Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms