Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MVB12AQ96EY5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms