Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAMP4Q969E2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms