Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG4Q92954 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms