Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRSK1Q8TDC3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms