Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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ZNF248Q8NDW4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNF248Q8NDW4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNF248Q8NDW4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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