Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRC17Q8N6Y2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms