Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS8Q8N3P4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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