Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms