Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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USP43Q70EL4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP43Q70EL4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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