Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
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LINC01545Q5VT33 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01545Q5VT33 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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