Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNT1Q5JUK3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms