Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms