Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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COL24A1Q17RW2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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