Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms