Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC18A3Q16572 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms