Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CST6Q15828 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CST6Q15828 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms