Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
R3HDM1Q15032 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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