Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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