Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.26■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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SHROOM2Q13796 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHROOM2Q13796 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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