Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD1Q13562 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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