Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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