Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TOP3AQ13472 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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