Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA4Q13439 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms