Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms