Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TROQ12816 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TROQ12816 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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