Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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