Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C2orf54Q08AI8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms