Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms