Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKD1P98161 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PKD1P98161 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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