Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRA2BP62995 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms