Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP1S2P56377 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms