Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms