Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTPAP49638 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTPAP49638 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTPAP49638 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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