Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC11A1P49279 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC11A1P49279 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC11A1P49279 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC11A1P49279 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC11A1P49279 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC11A1P49279 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms