Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFX3P48380 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX3P48380 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX3P48380 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX3P48380 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX3P48380 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX3P48380 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX3P48380 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFX3P48380 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms