Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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