Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF9P41273 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF9P41273 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms