Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNMT1P26358 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms