Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms