Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FGFR3P22607 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms