Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRAP18433 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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