Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPD1P17405 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms