Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL3L1P16619 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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