Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms