Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PKHD1P08F94 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms