Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYNP07948 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYNP07948 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYNP07948 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYNP07948 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYNP07948 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYNP07948 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYNP07948 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYNP07948 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYNP07948 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms