Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms