Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CLDN9O95484 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CLDN9O95484 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CLDN9O95484 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CLDN9O95484 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CLDN9O95484 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CLDN9O95484 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CLDN9O95484 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN9O95484 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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