Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SIX3O95343 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SIX3O95343 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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